De acordo com a Lei Complementar nº 566/2010 (alterada pelas Leis Complementares nº 577/2011, nº 598/2011 e nº 624/2012) os setores do Tribunal de Justiça do Estado do Espírito Santo se organizam da seguinte forma:
- Secretaria de Controle Interno
- Secretaria de Engenharia, Gestão Predial e Equipamentos
- Secretaria Judiciária
- Secretaria de Tecnologia da Informação
- Secretaria de Gestão de Pessoas
- Secretaria de Infraestrutura
- Secretaria de Finanças e Execução Orçamentária